Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd4Q6ZPR5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms