Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf653Q6YND2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms