Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms