Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms