Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms