Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFR5

Tra2a, Transformer-2 protein homolog alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2aQ6PFR5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tra2aQ6PFR5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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