Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc85bQ6PDY0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms