Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mfsd13aQ6PDE8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mfsd13aQ6PDE8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms