Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms