Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms