Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc3bQ6NWW9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms