Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SphkapQ6NSW3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms