Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pdcd11Q6NS46 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms