Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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