Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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