Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Krt40Q6IFX3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt40Q6IFX3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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