Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Swap70Q6A028 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Swap70Q6A028 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Swap70Q6A028 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Swap70Q6A028 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Swap70Q6A028 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Swap70Q6A028 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Swap70Q6A028 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Swap70Q6A028 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Swap70Q6A028 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Swap70Q6A028 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Swap70Q6A028 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swap70Q6A028 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms