Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk13Q69ZA1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms