Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltcQ68FD5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltcQ68FD5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms