Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8eQ66JT1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms