Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp9Q64HY3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Sp9Q64HY3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Sp9Q64HY3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Sp9Q64HY3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Sp9Q64HY3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp9Q64HY3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms