Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phc1Q64028 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms