Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Col4a5Q63ZW6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col4a5Q63ZW6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms