Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms