Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms