Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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