Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpd52Q62393 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms