Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ss18Q62280 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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