Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Six1Q62231 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Six1Q62231 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms