Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms