Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpaQ62189 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms