Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npm1Q61937 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms