Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gli3Q61602 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli3Q61602 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms