Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usf1Q61069 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usf1Q61069 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usf1Q61069 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usf1Q61069 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usf1Q61069 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usf1Q61069 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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