Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms