Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms