Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf4Q60793 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf4Q60793 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf4Q60793 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf4Q60793 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms