Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stxbp3Q60770 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms