Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mkrn3Q60764 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms