Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms