Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nr2f1Q60632 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms