Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms