Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brip1Q5SXJ3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms