Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms