Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms