Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms