Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Trim58Q5NCC9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim58Q5NCC9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms