Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5431Q5NCB3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5431Q5NCB3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms