Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Spata48Q5NC83 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Spata48Q5NC83 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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