Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810065E05RikQ5NC41 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1810065E05RikQ5NC41 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms